Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms