Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms