Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms