Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms