Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec31aQ3UPL0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sec31aQ3UPL0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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