Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms