Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms