Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms