Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms