Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 AV039307-201ENSMUST00000124795 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms