Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm45047-201ENSMUST00000207651 309 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm12479-201ENSMUST00000120731 1585 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm21287-201ENSMUST00000191377 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms