Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defb33Q30KN3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms