Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Rpusd2Q149F1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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