Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd12Q0VE29 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms