Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms