Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms