Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ttc21bQ0HA38 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ttc21bQ0HA38 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ttc21bQ0HA38 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ttc21bQ0HA38 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ttc21bQ0HA38 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ttc21bQ0HA38 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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