Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rbp2Q08652 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rbp2Q08652 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rbp2Q08652 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rbp2Q08652 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rbp2Q08652 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rbp2Q08652 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rbp2Q08652 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms