Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SctQ08535 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SctQ08535 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
SctQ08535 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SctQ08535 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SctQ08535 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms