Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms