Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms