Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms