Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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