Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Kcnb1Q03717 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Kcnb1Q03717 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Kcnb1Q03717 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Kcnb1Q03717 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Kcnb1Q03717 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Kcnb1Q03717 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Kcnb1Q03717 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Kcnb1Q03717 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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