Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms