Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prop1P97458 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms