Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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