Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gabpb2P81069 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gabpb2P81069 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gabpb2P81069 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gabpb2P81069 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gabpb2P81069 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gabpb2P81069 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gabpb2P81069 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gabpb2P81069 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gabpb2P81069 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms