Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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Irx2P81066 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Irx2P81066 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx2P81066 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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