Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps18P62270 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms