Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms