Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Faf1P54731 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms