Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rad23bP54728 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rad23bP54728 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rad23bP54728 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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