Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms