Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FmodP50608 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FmodP50608 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FmodP50608 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms