Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms