Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms