Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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