Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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