Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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