Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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