Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eif3aP23116 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms