Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RarbP22605 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RarbP22605 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RarbP22605 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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