Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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