Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Fcer1aP20489 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fcer1aP20489 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fcer1aP20489 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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