Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TP20293 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TP20293 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
TP20293 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TP20293 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TP20293 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TP20293 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TP20293 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TP20293 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TP20293 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TP20293 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TP20293 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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