Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms