Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pou4f1P17208 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms