Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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