Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms